Прошло несколько лес с тех пор как Хезер и ее мать побывали в городе Сайлент Хилл. Теперь Хезер вместе со своим отцом переезжают с одного города в другой, пытаясь скрыться от мистического преследования. Но Хезер как и раньше терзают ночные кошмары, сны в которых она оказывается в городе Сайлент Хилл, сны в которых она видит что-то ужасное. Ей скоро должно выполнится восемнадцать лет и естественно она хочет жить как живут все нормальные подростки. Но ей судьбой предначертано совершенно другое. Мистический ужас не желает ее отпускать. Однажды, когда Хезер возвращается домой, она обнаруживает что ее отец исчез, а на стене нарисован символ, в котором написано "отправляйся в Сайлент Хилл"...